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HealthXTalk#董恩盛：约翰霍普金斯大学新冠疫情地图
北京时间年2月28日周日早晨,在HealthX俱乐部线上举行的第二期HealthXTalk中，董恩盛博士热情澎湃的分享了关于约翰霍普金斯新冠疫情地图（JHUCovid-19Dashboard）的制作过程，以及作为一位二年级博士生在约翰霍普金斯大学“掌舵”这一历史伟大工程项目的心得体会。本文详细总结了活动的重点内容，以及参与讨论的教授们和小伙伴们的精彩点评互动。
首先，在分享董恩盛博士疫情地图的技术细节之前，HealthXClub想着重强调一点，新冠肺炎COVID-19是人类历史上的一场巨大的浩劫。自年12月以来，新冠肺炎COVID-19肆虐全球已超过一年时间。截止年4月5日，全球超过一亿三千万人感染新冠肺炎，死亡人数超过两百八十五万，造成了不可估量的巨大生命经济损失，同时也给全人类造成了巨大的心理创伤。引用世界卫生组织总干事谭德赛的一句话“Wemustrememberthatthesearepeople,notnumbers.”我们必须要记住,这些是人,不是数字。
世界卫生组织WHO年1月31日的Twitter：“我们必须要记住,这些是人,不是数字”
而在我们每个人都亲身经历的这场人类浩劫中，令人感同身受的是疫情信息快速更新的重要性。突如其来的这场新冠疫情使世界很多国家和地区因为公共卫生数据平台建设的不足而乱了手脚，各国的疫情信息也变成了嘈杂的数据孤岛。如何从全球的视角，及时准确的记录新冠疫情的发展是一个前所未有的工程挑战，更是新冠疫情时代最直接的人文关怀。秉承立足当下、经世致用的学术愿景，公共卫生文献中的种种疾病统计预测模型如果缺少了准确的数据来做支撑，也很难有用武之地。因此大规模而精准的疫情数据收集成了对新冠肺炎数据进行研究的重要前提。得益于约翰霍普金斯大学的疫情地图平台，很多问题得到了进一步解答。比如JHU疫情地图网站上CriticalTrends（关键趋势）上列举的这些问题
以及作为经历这场人类浩劫的普通人，我们也好奇
过去一年多时间里，全球每天有多少人感染？多少人死亡？
哪些地方感染和死亡的人数最多？新冠疫情增长的速度最快？
具体到每个省、市、州、郡、县等各国行政单位上又有多少人感染？
某个城市比如西雅图新冠疫情最近一周的趋势如何？什么时候可以“flattenthecurve”（增长放缓趋平）？
目前随着疫苗接种的普及，哪些地方接种的人数最多，接种的趋势和什么因素相关？
新冠肺炎的感染在时间和空间上是否呈现统计学趋势？而新冠肺炎传播的潜在数学模型是什么？
等等。
带着对这些问题的好奇，我们邀请全球最具影响力疫情地图JHUCovid-19Dashboard的架构师、JohnHopkinsBloomberg公共卫生学院的博士生董恩盛做客HealthXClub，和来自中美公共卫生领域的资深教授们还有医疗科技行业的伙伴们一起聊聊全球最具影响力新冠疫情地图背后的故事。
1.董恩盛介绍
董恩盛是约翰斯·霍普金斯大学土木与系统工程系博士生，师从LaurenGardner教授，研究方向是疾病模型，是约翰·霍普金斯大学疫情地图架构师。董博士此前接受过人民日报、新华社、科学杂志(Science)、自然杂志(NatureIndex)、华尔街日报(WallStreetJournal)、华盛顿邮报(WashingtonPost)等主流媒体的采访。董恩盛博士导师LaurenGardner和习主席、钟南山院士、福奇教授荣登《时代周刊》全球最具影响力百人榜。
2.HealthXClub介绍
HealthXClub于年1月由两位毕业于卡耐基梅隆大学和哈佛大学的数据科学家成立。我们志在探索前沿科技对健康医疗行业的颠覆性革命，从工程、产品、学术多维度挖掘、发现新一代医疗科技公司和团队。自成立以来，俱乐部每月不定期组织线上/线下的分享活动，为更多思维碰撞提供可能。辛丑牛年伊始，HealthX医疗科技俱乐部迅速扩张，现已聚集众多世界著名大学研究机构的的科学家（如哈佛、麻省理工、清华、北大、斯坦福、剑桥、耶鲁、卡耐基梅隆、MDAnderson癌症研究中心、伯克利、上海交通大学、UIUC、加州理工等），医疗科技公司的设计、研发、数据、产品专家（如药明康德、BenevolentAI、晶泰科技、PathAI、BrainCo、PrudentialFinancial、赛默飞世尔、阿斯利康、腾讯健康、RallyHealth、OscarHealth、微软、Facebook、NVIDIA、Petuum等），和专注医疗科技创新领域的企业家、创始人和投资人。我们期待更多志同道合的前辈和伙伴们加入交流！
3.约翰霍普金斯新冠疫情地图介绍
董博士首先播放了一段美国总统拜登在美国疫情死亡人数超过50万的时候发表的白宫讲话，而拜登提到的美国累计死亡人数，正来自于约翰霍普金斯新冠疫情地图JHUCOVID-19Dashboard（之后简称Dashboard）。CBSThisMorning的主持人也介绍了该节目依赖于Dashboard来为每天早上的新闻节目提供疫情数据更新。可见JHUDashboard在美国主流社会中的重要程度。
美国总统拜登在白宫讲话中引用JHUCOVID-19Dashboard数据
CBSThisMorning介绍JHUCOVID-19Dashboard
而其他各国主流媒体，比如新华社、新闻联播中报道美国疫情时经常提到的“美国约翰霍普金斯大学实时统计数据”也同样来自JHUCOVID-19Dashboard。
年4月6日新闻联播内容
首先让我们从产品的角度来看一下Dashboard（仪表盘）的构成。
最主要的就是dashboard中间这些红色的点所组成的地图。每个点代表当地所有的确诊病例，点越大，当然代表病例越多。但是每个点所代表的范围是不一样的，比如说在美国每一个点代表一个countylevel/郡县的水平。其他国家比如说英国、澳大利亚，加拿大、俄罗斯、巴西这些国家一个点是相当于一个state或者provincelevel，州或者省的一个级别的精细度，而在中国我们也是精确到省级单位。在dashboard左右两侧可以看到一些统计数据，左边和右边可以看到各个国家总感染人数，总死亡人数的列表。还有美国一些比较专门的数据，比如说美国的每一个州和郡县的死亡和确诊病例，而且还有美国各地的testingrate，检测率。接下来董博士团队还会添加美国各地的疫苗接种数据。Dashboard右下角是6种EpiCurve流行曲线，包括每日感染人数曲线、每日死亡人数曲线、累计感染人数曲线、累计死亡人数曲线、Log对数曲线。这些epicurve对于公共卫生研究者及政策制定官员是必须的。Dashboard中间红框中的部分还可以切换另四种不同的地图模式。ActiveCase（现存病理图）、IncidenceRate（患病率）、Case-FatalityRatio（确证病例中的死亡率）、TestingRate（检测率）。Dashboard上线的时间点也非常值得一提，年1月21日美国出现第一例新冠肺炎患者，第二天1月22日，JHUCOVID-19Dashboard上线，随后几个小时武汉封城。Dashboard在疫情全球大范围传播的早期上线，意味着其追踪到了全球疫情演变的全过程。
4.Dashboard创作过程
据董博士介绍，疫情地图起源于年1月21日他与导师一起喝咖啡时的一次讨论。1月21号，当时是我和我的老师LaurenGardner在讨论下一学期要做些什么，她知道我也在非常